Printr-o scrisoare trimisă de Departamentul Justiţiei, instituţia a fost informată că nu a luat măsuri suficiente pentru a proteja studenţii evrei şi israelieni care s-au simţit ameninţaţi de atmosfera de pe campus, în special în perioada 2023–2024, în contextul operaţiunilor militare din Fâşia Gaza.
Investigaţia se înscrie într-o serie mai amplă de acţiuni iniţiate de administraţia Trump împotriva unor universităţi de elită, acuzate de antisemitism şi de discriminare în politicile de admitere, în special faţă de bărbaţii albi. De asemenea, guvernul federal a redus semnificativ finanţările pentru cercetare destinate Harvard.
Universitatea Harvard reluase dialogul cu administraţia de la Washington în vederea atingerii unui acord. Preşedintele Donald Trump a declarat pe reţelele sociale, pe 20 iunie, că dacă se ajunge la un acord „în forma discutată acum, va fi istoric şi foarte benefic pentru ţară”, adăugând că liderii Harvard „au acţionat extrem de corect în timpul negocierilor”.
Administraţia Trump continuă să exercite presiuni asupra instituţiilor de învăţământ superior, susţinând că unele dintre acestea promovează ideologii părtinitoare şi nu combat eficient manifestările de ură. Universităţile vizate consideră însă că aceste măsuri constituie un atac la adresa autonomiei academice şi a libertăţii educaţionale.